鸡粪有机肥制作的很好方式是自然发酵
自然发酵是鸡粪有机肥制作的很好方式，可以把鸡粪平铺晒干，等到鸡粪的干度到达一定的程度就可以堆积起来，如果有条件在鸡粪有机肥堆上盖一层塑料布防止水分过渡流失，然后等待鸡粪自然升温。
当鸡粪的内部问题达到70度左右时，需要再次把鸡粪摊开，降温之后重新堆积起来，这样反复2-3次，待鸡粪堆不在升温到50摄氏度以上时，发酵就完成了。
发酵后的鸡粪，是葡萄和西瓜、果树和蔬菜的很好的肥料。选择在通风好的地方、地势高的地方，将清理出的新鲜鸡粪堆积成一堆，外面用泥浆封闭。一般的夏季需10天左右，冬季2个月左右。将新鲜的纯鸡粪与切碎的饲草和水果、废弃的蔬菜废物，其中与非豆科类饲草的效果是很好的。新鲜的纯鸡粪可以直接喂猪、喂鱼，在饲喂时根据不同的鸡粪含不同的有效成分来添加。喂猪时，每日的饲料粮中按15%的比例，将鸡粪直接加入。
鸡粪未经腐熟而直接施用到作物上，存在很大的害处及隐患：直接施在土壤中，在合适条件下发酵并产生大量的热量，烧毁作物根系，同时鸡粪本身带有大量病菌，给作物带来病害隐患。经过发酵后，一是均衡了有机肥中的酸碱性，减少了消酸盐含量，补充了水分，有利与自然界土壤中微生物菌的组合应用; 二是发酵后能杀灭原粪肥中寄生的虫卵、***生物病菌等，防止鸡粪直接给作物和土壤带来的病菌与危害。
