要改善碱性土壤，要用以植物纤维为主要成分的有机肥像以秸秆和食草动物粪便制作的有机肥，含有的能量少，但是时间持久；那么以豆粕和鸡粪一类的制作的有机肥，肥效大，肥效也相对较快。
正确使用有机肥能快速增加土壤有机质，提高土壤透气性，缓解土壤疲劳，提高土壤的缓冲能力，为作物的生长提供良好的环境。有的农民认为有机肥中的有机物、有机质含量越高越好，可以促进土壤团粒结构的形成。事实上判断有机肥好坏，关键看原料，看肥效。
生物有机肥中有大量的有益微生物，能分解土壤中的有机物，增加土壤的团粒结构，改善土壤组成。微生物在土壤中的繁殖速度非常快，他们就像一张看不见的大网，错综复杂。微生物的菌体死后，在土壤中留下了很多微细的管道，这些微细的管道不但增加了土壤的透气性，而且还使土壤变得蓬松柔软，养分水分不易流失，增加了土壤蓄水蓄肥能力，避免和消除了土壤的板结。
有机质的矿化作用
⑴不含氮有机物的分解 多糖化合物（淀粉、纤维素、半纤维素）首先在微生物分泌的水解酶的作用下，水解成单糖。葡萄糖在通气良好的条件下分解迅速，酒精、醋酸、草酸等中间产物不易积累，***终形成CO2和H2O，同时放出大量热能。如果通气不良，在嫌气微生物作用下，单糖分解缓慢，产生热量少，并积累一些中间产物-有机酸。在极嫌气微生物条件下，还会生成CH4、H2等还原态物质。
