在发酵物料的后处理方面，大多数企业加入功能菌进行复配、定形，产品剂型以粉尘为主，但也有采用滚筒造粒或挤压造粒的。颗粒产品克服了粉的剂产品外观差、层次低的缺点，提高了产品的商品性，但同时也提高了企业的生产成本，并对有效菌的存活产生了一定影响。 由于生物有机肥相比普通有机肥生产成本较高，主要应用在蔬菜、水果、***等高附加值的经济作物上，并取得了较好的效果。
生物有机肥的生产主要包括发酵菌促进物料腐熟过程、添加功能菌二次发酵过程和成品加工过程。通过发酵使物料完全腐熟是整个生产的关键环节，在发酵腐熟阶段，多数企业采用槽式堆置发酵法。水分、C/N 比、温度、pH、通风情况等过程参数直接影响物料腐熟的程度和发酵周期。待物料完全腐熟后，添加固氮菌、溶磷菌、解钾菌等复合功能菌群进行二次发酵， 通过控制发酵条件提高产品中的有益活菌数， 从而达到增强生物有机肥肥效的目的。发酵结束后，为了提高产品的商品性和保证产品中有益微生物的存活率， 成品加工多以圆盘造粒后低温烘干工艺为佳。
生物有机肥：生物有机肥中的有益微生物进入土壤后与土壤中微生物构成互相间的共生增殖关系，抑止***菌生长并转化为有益菌，互相作用，互相促进，起到群体的协同作用，有益菌在生长繁衍过程中产生大量的代谢产物。促使有机物的合成转化，能直接或间接为作物提供多种营养和刺激性物质，促进和调控作物生长。
鹏程生物生产及销售生物有机肥、精制有机肥、颗粒有机肥、鸡粪有机肥、有机无机复混肥、叶面肥、水溶肥等产品.
