盐化棚内土壤，果实不开个
连年使用鸡粪，土壤中存留大量的氯化钠盐，平均每6方鸡粪含盐分30-40公斤，而每亩地含10公斤盐分已经严重制约土壤通透性和活性，固化磷肥、钾肥、钙镁锌铁硼锰等重要元素，出现植株生长异常，花蕾稀落，果实不开个等减产现象，显著制约了作物产量和质量的提高。
因此造成了肥料利用率直线下降，一年不如一年，增加了投入成本50-100%。
病毒病，疫病，茎基腐病，根腐病，青枯病成为使用鸡粪明显的后遗症。
此外，鸡粪偏酸性，会加剧土壤酸化，导致作物病害。相较于猪粪、牛粪等畜禽粪便，鸡粪中的扛生素和***含量往往较高。
“扛生素主要来源于饲料。由于鸡的养殖密度大，防疫要求高，在畜禽中扛生素使用量相对较大，加之鸡的消化道短，很少数养殖场在饲料中添加的扛生素，更容易通过粪便排出。
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鸡粪未经腐熟而直接施用到作物上，存在很大的害处及隐患：直接施在土壤中，在合适条件下发酵并产生大量的热量，烧毁作物根系，同时鸡粪本身带有大量病菌，给作物带来病害隐患。经过发酵后，一是均衡了有机肥中的酸碱性，减少了消酸盐含量，补充了水分，有利与自然界土壤中微生物菌的组合应用; 二是发酵后能杀灭原粪肥中寄生的虫卵、***生物病菌等，防止鸡粪直接给作物和土壤带来的病菌与危害。
只有放错地方的资源，没有废弃物，这是循环农业很为重要的特点之一。鸡粪是非常的农家肥，对使用鸡粪的农作物生长起到很好的作用。鸡粪中含有丰富的有机质，并且氮、磷、钾三元素的含量非常高，一般情况下一份鸡粪当中含有1.63%的氮、1.54%的磷、0.85%的钾元素。这样高的含量是牛粪和猪粪没有办法比的。除此之外鸡粪当中还含有大量的微量元素，腐熟之后的鸡粪非常适合给农作物施用。
