精制有机肥具有氮、磷、钾三种基本养分外，还含有钙、镁、硫、铜、锌、铁、锰、硼、钼等多种中微量元素。氨基酸gt;7%，有机质≥30%，腐殖酸≥8%，氮磷钾≥5%，钙镁硫总量≥8%，铁锰锌硼钼等微量元素0.3-1%；pH值6-8，水分lt;10%。作物秸秆的C/N在100左右，施入土中，改良土壤的作用很大，由于所含氮素数量很少，在分解腐烂过程中不仅不能释放出氮素，还要从土壤中吸收氮，秸秆还田时有的地方要加施一点化学氮肥才能加速腐解过程。
有机肥实用范围较广，大田作物水稻、玉米、花生、小麦等；经济作物大豆、棉花、芝麻、甘蔗、茶叶、草等；瓜果蔬菜、柑橘、脐橙、草莓、龙眼、菠萝、柚树、香蕉、枇杷、猕猴桃、荔枝、苹果、梨、葡萄等；苗木花卉、园林植物、***等，均可施用。
据中国农业年鉴1990年资料，中国存栏数约3.4亿头，牛近1亿头，马骡驴2700万匹，这些家畜排泄物数量大，养分丰富，是中国农村大的有机肥资源。其中猪每年可为农业生产提供氮素130多万吨，磷素85万吨，钾素180万吨；大牲畜可提供氮160多万吨，磷83万吨，钾110多万吨。有的有机肥料改良土壤，培肥地力的作用大一些，如秸秆、草炭、堆肥等等。加上每年有30多亿只家禽和10多亿只兔，其提供的养分量占农村有机肥料总量的63%～72%。
肥料处理编辑有机肥料无害化处理的堆、沤方法也很多，但是上海有机蔬菜肥料是采用EM堆腐法、自制发酵催熟堆腐法和工厂化无害化处理等。EM堆腐法EM是一种好氧和嫌氧有效微生物群，主要由光合***、酵母菌和乳酸菌等组成，在农业和环保上有广泛的用途。它具有除臭、杀虫、杀菌、净化环境和促进植物生长等多种功能。瓜果蔬菜、柑橘、脐橙、草莓、龙眼、菠萝、柚树、香蕉、枇杷、猕猴桃、荔枝、苹果、梨、葡萄等。用它处理人、畜粪便作堆肥，可以起到无害化作用。其具体方法如下：（1）购买EM原液。然后，按清水100毫升和蜜糖或红糖20--40克、M酪100毫升、烧酒（含酒精30%～35%）100毫升和EM原液50毫升的配方，配制成备用液。
其他肥料此外还有泥肥、熏土、坑土、糟渣和饼肥等。土肥类应经存放和晾干、糟渣和饼肥经腐熟后用作基肥。