复杂一点的的鸡粪有机肥生产工艺流程为：有机肥原料（动物粪便、生活垃圾、枯枝烂叶、沼渣、废弃菌等）发酵后进入半湿物料粉碎机进行粉碎，然后加入氮磷钾等元素（纯氮、P2O5、KCL、氯化铵等）使所含矿物元素达到有机肥执行标准，然后由搅拌机进行搅拌，再进入造粒机制颗粒，出来后烘干，通过筛分机筛分，合格产品进行包装，不合格的返回造粒机进行造粒。
鸡粪中含有丰富的有机质，含有较高N、P、K及微量元素，是很好的有机肥料原料。干鸡粪有机质含量达50%、氮3.2%、磷（以P2O5计）3.1%、钾（以K2O计）2.4%，养分含量丰富，同时含有大量的蛋白质，是目前粪便中很好的制做有机肥原料。 鸡粪堆肥发酵主要是利用生物作用结合***的机械工艺，对鸡粪进行有效处理，常用的工艺方法是好氧发酵。采用好氧发酵，鸡粪堆肥起温快，发酵温度高，腐熟周期短。由于其发酵温度高，能有效地杀掉鸡粪中的虫卵、病菌、植物种子等，在有效的机械搅拌作用下，其干燥效果也是非常显著。
鸡粪有机肥虽含有丰富的有机质和作物需要的各种养分，但营养元素含量较低，难以满足作物对大中营养元素的需要，因此与化肥相配合，才能均衡提供作物营养成分，保证农作物产品。一般可将40—60%的氮肥、全部磷肥和80%的钾肥与鸡粪有机肥一起作底肥施用。鸡粪有机肥一般作底肥，地表撒施手随耕翻深施入土，避免地表撒施现象，减少肥料的损失浪费和环境污染。
