在发酵物料的后处理方面，大多数企业加入功能菌进行复配、定形，产品剂型以粉尘为主，但也有采用滚筒造粒或挤压造粒的。颗粒产品克服了粉的剂产品外观差、层次低的缺点，提高了产品的商品性，但同时也提高了企业的生产成本，并对有效菌的存活产生了一定影响。 由于生物有机肥相比普通有机肥生产成本较高，主要应用在蔬菜、水果、***等高附加值的经济作物上，并取得了较好的效果。
生物有机肥在改善农产品品质方面发挥着不可替代的作用，但目前生产和销售还存在一定困难，这是因为对的农产品并没有完全做到优价，在一定程度上影响了种植户的积极性，使得生物有机肥的推广遇到了较大困难。
近年来，生物有机肥在一些生态示范区、绿色和有机农产品基地得到了较为广泛的应用，这是生物有机肥今后发展的主要方向。随着绿色有机农产品生产规模的扩大和人们消费水平的提高，生物有机肥的生产应用必是主流。
化肥药利用率稳步提高，是多项技术、多个因素聚合的结果。
一是科学施肥用药理念深入人心。化肥药减量增效成为各地的推进绿色发展的重要内容，减量增效理念深入人心，社会各界普遍认同。
二是节肥节药技术大面积推广。测土配方施肥、水肥一体化、机械深施、有机肥替代和生态调控、物理防治、生物防治、精准施药等节肥节药技术大面积推广应用。目前，***测土配方施肥技术应用面积19.3亿亩次、技术覆盖率达到89.3%，绿色防控面积超过8亿亩。
