基于目前化肥使用和农业废弃物现状， 积极寻求环保的化肥替代品， 积极探索农业废弃物资源化利用的方式，已成为国内外农业研究的热点。在此背景下， 生物有机肥以其独特的优势为农业废弃物和作物生长搭建起一座桥梁，开辟出一条以“农业废弃物－生物有机肥－作物”为循环模式的可持续发展道路。施用生物有机肥是提高土壤基础地力、改善农产品品质的重要途径。生物有机肥研制和生产的初衷是集有机肥料和生物肥料优点于一体， 既有助于提高作物产量，又能培肥土壤、调控土壤微生态平衡、减少无机肥料用量， 从根本上改善农产品品质， 符合中国农业可持续发展和绿色农产品生产的方向。
现阶段， 国内种植户施用生物有机肥的积极性不高，生物有机肥使用率相对较低，主要在蔬菜、水果、***、烟和草等附加值较高的经济作物上应用。但随着人们消费水平和安全意识的提高， 对绿色有机农产品的需求日益增强， 生物有机肥将会成为农业生产的必然选择。
目前，生物有机肥在一些生态示范区、绿色和有机农产品基地应用取得了较好的效果， 这对生物有机肥今后的推广应用起到良好的示范作用。
国内外大量研究表明， 施用生物有机肥可以有效防治土传病害。利用对枯萎病有拮抗作用的多黏类芽孢菌制成的生物有机肥， 其田间防治效果达到73％。由枯草芽孢菌Ⅱ-36 和Ⅰ-23 分别制成的茄子专用生物肥BIO-36 和BIO-23， 经盆栽试验验证，这两种肥料均能有效***茄子青枯病， 防病率分别为96％和91％。目前，生物有机肥在防治蔬菜、水果、***等作物土传病害方面效果十分显著， 是防治土传病害的一条重要且有效的生态调控防病途径。
四、生物有机肥能促进化肥的利用，提高化肥利用率；化肥单独使用易造成养分的固定和流失。
五、生物有机肥完全腐熟，不烧根，不烂苗；精制有机肥未经腐熟，直接使用后在土壤里腐熟，会引起烧苗现象。
六、生物有机肥经高温腐熟，杀了大部分病原菌和虫卵，减少病虫害发生；精制有机肥未经腐熟，在土壤中腐熟时会引来地下害虫。
