肥料是植物的粮食，施肥是农业生产中保证作物高产、稳产必不可少的重要手段。我国是世界上化肥生产和消费的大国，化肥使用量很大，虽然在一定时间和一定程度上提高了作物的产量，但对土壤、水源、农产品和环境造成的危害日益增加，如：土壤酸化、板结、营养失衡、地下水污染、农产品***和消酸盐含量超标等，导致多种生态环境污染和人类***发生。由于重施、乱施化肥，不注重施用有机肥，造成土壤有机质缺乏，导致土壤肥力下降，已成为影响我国农业持续发展和农作物稳产、高产的重要限制因素。
生物有机肥生产的技术含量相对较高，除了在腐熟过程中要加入促进有机物料腐熟、分解的生物菌剂，以实现定向腐熟、除臭等目的外，在产品中还需要加入具有特定功能的微生物，以提升产品的作用效果。目前，我国从管理上将生物有机肥纳入微生物肥料范畴，实施比有机肥更为严格的管理措施，以促进有机肥的健康发展。
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四、生物有机肥能促进化肥的利用，提高化肥利用率；化肥单独使用易造成养分的固定和流失。
五、生物有机肥完全腐熟，不烧根，不烂苗；精制有机肥未经腐熟，直接使用后在土壤里腐熟，会引起烧苗现象。
六、生物有机肥经高温腐熟，杀了大部分病原菌和虫卵，减少病虫害发生；精制有机肥未经腐熟，在土壤中腐熟时会引来地下害虫。
