果园施用生物有机肥后显着提高了果实可溶性固形物，苹果由14.1%提高到15.6%，李子由10.6%提高到12.2%，桃由10.1%提高到11.3%，葡萄由15.1%提高到16.6%；苹果的硬度由8.1提高到8.9，桃的硬度由9.1提高到11.1；苹果糖酸比由19.6提高到28.2，葡萄糖酸比由17.8提高到26.1。在桃树上喷施生物有机肥后，果实可溶性固形物提高了5.7-10.9%，果实风味和品质有所改善。
2015年以来，农业农村部按照***部署，深入开展化肥药零增长行动，推进化肥药减量增效，取得明显成效：经科学测算，2019年我国水稻、玉米、小麦三大粮食作***肥利用率为39.2%，比2017年提高1.4个百分点，比2015年提高4个百分点；药利用率为39.8%，比2017年提高1.0个百分点，比2015年提高3.2个百分点，有望实现到2020年化肥药利用率达到40%的目标。
微生物菌肥不宜与杀菌剂、***、除草的剂同时使用，也不要在使用生物菌肥后再实行土壤消毒。生物菌肥适宜的土壤湿度为60%左右，所以要注意不要在过分干旱时使用。生物菌肥对于阳光中的紫外线敏感，不宜采用地表撒施，可以在阴天或清晨、傍晚于土壤中施用。生物菌肥施入土壤后，有一个菌群繁殖壮大的过程，因此，在果树根系开始生长前使用。
在生物有机肥的生产过程中需有效地控制影响有机废物发酵、微生物繁殖的各因素。主要的影响因素为有机质含量、含水率、碳氮比、堆肥过程的氧浓度和温度以及pH值等。一方面，通过对诸因素的控制满足各微生物菌的种的生长繁殖所必需的碳氮比、温度、湿度、pH值、氧量及其它的营养元素;另一方面，不同的营养物质含量可产生不同效果的肥效，比如含碳量高有助于土壤***增多，氮则有助于土壤***增多，而钙对于作物抗病有明显的效用。
