蛋白石一般具有玻璃光泽或蜡状光泽，但是由于地质运动的各种变化，有些产地的蛋白石会出现非常高的瓷化效果，甚至媲美陶瓷。结构编辑蛋白石常为致密块状、粒状、土状、钟乳状、状、多孔状等。内部具球粒结构，集合体多呈葡萄状、钟乳状。底色呈黑色、乳白色、浅***、桔红色等。半透明至微透明。玻璃光泽、蜡状光泽、蛋白光泽。具变彩效应。性脆，易干裂，贝壳状断口。
在长波紫外线照射下，不同种类的蛋白石发出不同颜色的荧光。分类编辑有两个变种：变彩蛋白石和不变彩蛋白石。在市场上一般不变彩蛋白石会被称为蛋白石（potch）， 而变彩蛋白石则被称为贵蛋白石/欧泊（opal）。变彩蛋白石会因二氧化硅球体的尺寸略大于可见光的波长或可见光的半个波长时，使白光产生衍射和干涉才表现出从紫到红的全光谱色或较单调的某些光谱色
质地越细腻越好，的会象煮熟的鸡蛋白，嫩如婴孩的肌肤。雨花石蛋白石分多种，有细蛋白、粗蛋白、花蛋白、特异蛋白石、料子蛋白石等多种中国蛋白石特指国内有蛋白石，多指哈密地表蛋白石，无明显虹彩效果，色温润沉稳，为中国独有宝石类，资源已近枯竭，与澳大利亚欧珀有很大区别。质地坚硬，可媲美和田玉，跟古代和氏璧中描述的特点接近，可以"传国玉玺"。地下蛋白石有待进一步开发，但储量小，勘探，开采难度较大。
地中海蛋白石主要是指在地中海沿岸或者岛屿出产的蛋白石，这个区域出产的蛋白石无虹彩效应，但是包含了蓝，红，绿，黄，白等多种颜色。由于上亿年的地壳运动，使得深海的二氧化硅胶质体包裹着矿物和有机物质被逐渐抬翻到地表，在地中海气候的影响下，该区域的蛋白石的化学结构也变得非常稳当，这一特性与澳大利亚产的变彩欧泊有点相似。