莲子味甘、涩，性平（鲜者甘平，干者甘温），入心、脾和肾经，具有补脾止泻、养心安神、益肾固精的功效。据《玉楸药解》记载：“莲子甘平，甚益脾胃，而固涩之性，最宜滑泻之家，遗精便溏，极有良效”。莲子对体质虚弱之心慌、失眠多梦、遗精者，脾气虚之慢性腹泻者及妇女脾肾亏虚之白带过多者均有较好疗效，如与其他健脾胃食品如山药、芡实、扁豆、薏苡仁、菱实等一同食用，更好。
由于莲子具有固涩作用，平素大便干结难解，或腹部胀满之人忌食。 据现代科学分析，每100克莲子干品中含蛋白质16.6克，脂肪2.0克，碳水化合物62克，钙89毫克，铁6.4毫克，磷285毫克，其中淀粉和棉子糖含量较多，脂肪中脂肪酸组成有54.17%亚油酸，21.91%油酸，11.32%棕榈酸，6.19%亚麻酸和0.04%肉豆蔻酸，还含有抗氧化作用很强的维生素C和谷胱甘肽。 此外莲子所含的氧化黄心树宁碱有抑制鼻咽癌的作用。
莲子中的莲心味苦，性寒，具有清心安神、交通心肾、涩精止血功效，主治热入心包、神昏谵语、心肾不效、失眠遗精、血热吐血，并具有降压及抗心律失常功能。 在国家卫生部公布的药食同源食品种类中，莲子已被列入既是食品又是药品的名单中，表明莲子可作为安全可靠的保健食品原料之一加以运用。 完美营养餐中添加莲子营养素成分，使产品营养更丰富。