与精制相比:
精制有机肥是畜禽粪便经过烘干、粉碎后包装出售的商品有机肥。
1）生物有机肥完全腐熟，不烧根，不烂苗；精制有机肥未经腐熟，复合生物菌肥生产，直接使用后在土壤里腐熟，会引起烧苗现象。
2）生物有机肥经高温腐熟，大部分病原菌和 虫卵，减少病虫害发生；精制有机肥未经腐熟，在土壤中腐熟时会引来地下害虫。
3）生物有机肥中添加了有益菌，由于 菌群的占位效应，减少病害发生；精制有机肥由于高温烘干，杀了里面的全部微生物。
4）生物有机肥养分含量高；精制有机肥由于高温处理，造成了养分损失。
5） 生物有机肥经除臭，气味轻，几乎无臭；精制有机肥未经除臭，返潮即出现恶臭。
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生物有机肥改善作物农艺性状、使作物茎杆粗壮，叶色浓绿，开花提前，做果率高，果实商品性好，提早上市时间。增强作物抗病性和抗逆性、 减轻作物因连作造成的病害和土传病害，降低发病率；对花叶病、黑胫病、***病等的防治都有较好的效果，复合生物菌肥厂家，同时增强作物对不良环境的综合防御能力。
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1937年，苏联微生物学家克拉西尼科夫和密苏斯金研制了“固氮菌剂”。从而开创了菌肥料的先河，由于种种原因，这种微生物肥料都先后停止了大规模生产。1940年前后，亚洲研制了一种以蓝菌（藻类）为主而用于稻田的生物肥料。其在持续农业中仍然发挥着巨大的作用。
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